O primeiro filme completo de animação chega aos grandes ecrãs com histórias nunca contadas das origens de Scooby-Doo e um dos maiores mistérios da carreira de Mystery Inc.. Vamos ver como Shaggy e Scooby se conheceram e como foram apresentados aos jovens detectives Fred, Velma e Daphne para formarem a Mystery Inc.. Agora o grupo tem o seu maior desafio, que envolve um enredo para libertar o cão fantasma Cerberus no mundo.
